压力蒸汽灭菌器大多数都用在固体实验废弃物的消毒灭菌，避免实验室内部感染性因子扩散到实验室外部，避免对实验人员和实验环境的影响。压力蒸汽灭菌器是一种能承受压力的容器，使用的过程中具有一定的安全风险，如发生爆炸、性能缺陷导致灭菌不彻底造成病原微生物扩散等，因此，应严格依规定要求使用及维护，灭菌效果的监测以及安全性能检验测试，确保灭菌效果和防止发生爆炸等安全事故。
压力蒸汽灭菌器发生爆炸的根本原因有安全阀没有定期检验或测试，发生锈蚀、堵塞，在高压时无法排气泄压；灭菌器控制管理系统不稳定或压力、温度传感器发生偏离，造成灭菌器长时间超压工作；超期限使用或壁体受损，壁体没办法承受设计的压力；使用不符合国家标准的产品等。这些原因都可能会造成使用的过程中的安全事故。正常的情况下，按照以下程序进行处置。
实验室若发生压力蒸汽灭菌器爆炸事故，首先应立即断电，停止压力蒸汽灭菌器的运行，如有人员伤害，应立即组织对受伤人员进行救治，同时立即向实验室主任报告，启动应急预案并保护好现场；如有火情发生，应第一时间向“119”报警，视现场火情情况(具体参见后述“火灾”章节的要求做处置)在条件允许的情况下对火情来控制，如果情况紧急，火势无法控制时，应立即撤离实验室；如果没发生火情和人员伤害，应关闭电源后保护好现场，等待有关人员进场调查取证。现场调查完成后及时清理现场的残留物品；事后应对爆炸发生的原因做多元化的分析评价并采取一定的措施，消除安全隐患，防止同类事故再次发生。
首先应立即断电，防止事故的逐步扩大；确认现场有无人员受到伤害，如有人员受伤，应立即拨打“120”救助电话；如有火情，应立即通过“119”报警，并判断火情是不是能够控制，在能控制的情况下，首先采取一定的措施控制火情；如果确定火情无法控制时，人员应立即撤离事故现场；应尽可能保护好现场，为后面的事故调查提供真实原始的现场。
